Ubicado en la zona centro del estado, colinda al norte con Namiquipa, en la parte este con Riva Palacio, al sur con Cuasihuiriachi y Gran Morelos y al este limita con los municipios de Bachíniva y Guerrero. La extensión territorial total del municipio de Cuauhtémoc es de 3,810.90 kilómetros cuadrados, y está situado a una altura promedio de 2,060 metros sobre el nivel del mar.